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第一百八十三章 老裘,你的病有救啦!(5.4K) (第5/8页)
如果是培养皿培育出的菌株,检测或者对比的难度往往都不高。 但对象若是自然界富集的样本,cao作起来就比较麻烦了。 徐云所说的16S相似度检测,指的是核糖体小亚基的RNA组分检测。 也就是16SrRNA。 这部分长度大约1500nt,不同物种略有差异,算是目前主流的九大新物检测步骤之一。 五分钟后。 裘生抬起头,对徐云道:退出转码页面,请下载app爱读小说阅读最新章节。 “老徐,准备好了,引物你觉得用啥?” 徐云想了想,很快道: “1492R吧。” “好嘞!” 半个小时后。 裘生抬起头,打了个响指: “搞定,扩出来了,BLAST的密匙你有吧?” 徐云朝他竖起一根大拇指示意干得漂亮,随后走到cao作台边,噼里啪啦的输了一大串密匙。 做过新种检测的同学应该都知道。 16S相似度检测的界限其实有些模糊,因为不同分类群的检测相似度阈值是不一样的。 比如有的是97%,有的是99%。 只是在通常情况下。 相似度超过97%的,就可以认为是一个物种。 相似度低于97%的,就可以认为是不同物种,进行下一阶段检测。 不过就是这样一种不太精细的检测手段,却依旧是很多新物检测迈不过去的一道坎: 大部分样本在经过检测之后,都会发现相似度在99.99%以上,与其他某某微生物是同
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